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Job shadowing (Year 10, Year 11 students) See https://www.math.univ-paris-diderot.fr/diffusion/index
Key figures
Key figures
189 people work at LJLL
86 permanent staff
80 researchers and permanent lecturers
6 engineers, technicians and administrative staff
103 non-permanent staff
74 Phd students
15 post-doc and ATER
14 emeritus scholars and external collaborators
January 2022
A voir
Séminaire du LJLL : A. Carbone
20 novembre 2015 — 14h00
Alessandra Carbone (Université Pierre et Marie Curie Paris VI)
Représentations uni- et tri-dimensionnelles des protéines et applications
Résumé
En biologie computationnelle, une question fondamentale est l’extraction d’information à partir d’une famille de séquences protéiques. Etant donné une séquence protéique, nous décrirons comment une correspondance précise entre la représentation unidimensionnelle (la séquence) et la représentation tridimensionnelle (la structure) de la protéine fait apparaître des informations biologiques importantes sur les sites d’interaction protéine-protéine et sur les propriétés mécaniques et allostériques des protéines. Couplée avec un modèle réductionniste des interactions moléculaires, cette correspondance s’est révélée fondamentale pour identifier les partenaires protéiques et a été à l’origine de progrès considérables sur le problème de la reconstruction des réseaux d’interaction protéine-protéine (PPI).
Rappelons que les PPI se trouvent au coeur des processus moléculaires qui gouvernent la vie et et que leur compréhension constitue un objectif essentiel pour la conception de médicaments. Etant donnée leur importance, il est fondamental de déterminer quelles interactions protéiques sont fonctionnellement importantes et de caractériser le comportement compétitif des protéines dans un environnement surpeuplé comme le milieu cellulaire. Des outils mathématiques appropriés sont nécessaires pour traiter efficacement ces problèmes, et nous les présenterons dans cet exposé.