Séminaire/groupe de travail Math/Bio


Université Pierre-et-Marie-Curie (Paris 6), Laboratoire Jacques-Louis Lions (accés au LJLL)


Organisateurs: Luís Almeida, Benoit Perthame, Delphine Salort et Michèle Thieullen.

Les exposés ont lieu à la salle 309, 3ème étage, tour 15-16, Jussieu.

Pour faire partie de la liste de diffusion inscrivez-vous à https://ljll.math.upmc.fr/cgi-bin/mailman/listinfo/mathbio





Année 2016 :

Lundi 30/05/2016


14h  -   Jean-Pierre FRANCOISE (LJLL) : Algebraic Geometry of Bifurcations and its Applications for models in Biology.

15h  -   Dongmei XIAO (Shanghai Jiao Tong University)  : Traveling waves for reaction diffusion population models with spatio-temporal delays.



Lundi 23/05/2016  Second meeting on mathematical modeling and control in epidemic spread

Program:

9:30 - 9:40   Welcome
9:40 - 10:20   Max Souza (Universidade Federal Fluminense, Rio de Janeiro, Brasil) : Vector borne diseases on an urban environment.
10:20 - 10:45   Coffee Break
10:45 - 11:25   Anton Camacho (London School of Hygiene and Tropical Medicine, UK) : Explaining the past, predicting the future: two contributions from the mathematical modelling of Ebola                                                                                                                                                 outbreaks.
11:30 - 12:10   David Salthouse (CNRS, Ecole Normale Supérieure Paris) : French Polynesian dengue epidemics : The coupling of phylogeny and mathematical models.
        LUNCH
14:00 - 14:40   Gael Raoul (CMAP, Ecole Polytechnique) : Virulence evolution at the front line of an epidemics.
14:45 - 15:25   Matthieu Alfaro (Université de Montpellier) : Pulsating fronts for a reaction diffusion system as a model in evolutionary epidemiology.
15:30 - 16:00   Coffee Break
16:00 - 16:40   Panagiotis Souganidis (University of Chicago, USA) : Front propagation: homogeneous, periodic and random media.



Lundi 04/04/2016


14h30  -   Jacques BELAIR (Univ. de Montréal) : Feedback, retards et oscillations dans la régulation hématopoiëtique.




Lundi 14/03/2016


14h  -   Anne BOURDON (LPP, Ecole Polytechnique) : Simulation of helium discharges in capillary tubes and plasma jets for biomedical applications.

15h  -   Florence DEBARRE (CIRB, Collège de France) : Evolution in spatially heterogeneous environments.




Lundi 15/02/2016


14h  -   Grégory DUMONT (ENS Ulm) : An age structured model for a neural network.

15h  -   Michèle THIEULEN (LPMA, UPMC) : Etude d'un modèle d'Hodgkin-Huxley soumis à une stimulation aleatoire à drift périodique.




Lundi 25/01/2016


14h  -   Teresa TEIXEIRA (Institut de Biologie Physico-Chimique) : The many routes that lead to cellular senescence.

15h  -   Thibault BOURGERON (ENS Lyon) : Hétérogénéité d’un modèle probabiliste pour la sénescence réplicative.







Année 2015 :

Mardi 01/12/2015


14h  -   Leonid BERLYAND (Penn. State Univ.) : Sharp interface limit in a phase field model of cell motility.

15h  -   Emmanuel FARGE (Institut Curie) : Mechanical activation of gene expression in major transitions of ancestral animal evolution and tumor progression.




Lundi 09/11/2015


14h  -   Julien CHEVALlIER (Univ. de Nice) : Spiking neural models: from point processes to partial differential equations.

15h  -   Stéphane MISCHLER (Univ. Paris Dauphine) : Modèles de réseaux neuronaux dans un régime de petite connectivité.




Lundi 12/10/2015


14h  -   Igor ROUZINE (University of California San Francisco) : An Evolutionary Role for HIV Latency in Enhancing Viral Transmission.





Lundi 29/06/2015


14h  -   Konstantina TRIVISA (University of Maryland) : On nonlinear models for tumor growth: Global existence of weak solutions.

15h  -   James NOLEN (Duke University) : Logarithmic delay of KPP fronts in heterogeneous media.





Lundi 08/06/2015 
Rencontre Mathematical modeling and new methods for dengue control, partie 2


14h       Fabrice Vavre (CNRS, Université Claude Bernard): Using Wolbachia to limit Dengue transmission: an evolutionary perspective

14h50   Pierre Alexandre Bliman (Fundaçao Getulio Vargas): Ensuring the success of biological control of mosquito-borne diseases by bacteria Wolbachia, through
                                                                                                  almost global stabilizing feedback.

15h40   Daniel Villela (Fiocruz): Mosquito population dynamics of Aedes aegypti in Brazil: estimation of spatial density and analysis of invasion potential of
                                                    Wolbachia.



Lundi 01/06/2015  Rencontre Mathematical modeling and new methods for dengue control, partie 1


14h       Claudia Codeço (Fiocruz): Surveillance and control of dengue in Brazil: new questions requiring new models

14h50   Bernard Cazelles (IBENS, ENS): Statistical and mathematical approaches for a better understanding of dengue dynamics

15h40   Flavio Coelho (Fundaçao Getulio Vargas): Estimating the Attack Ratio of Dengue Epidemics under Time-varying Force of Infection
                                                                                  using Aggregated Notification Data




Lundi 18/05/2015


14h  -   Lucie LAPLANE (Institut Gustave Roussy) : Identité des cellules souches: philosophie et biologie.

15h  -   Eddy PASQUIER (Univ. Aix-Marseille) : Optimising the anti-angiogenic activity of chemotherapy: impact of dose, schedule and drug combination.




Lundi 23/03/2015


14h  -   Fanny JAULIN (Institut Gustave Roussy) : Comportements collectifs dans la dissémination des cancers colorectaux.

15h  -   Coralie FRITSCH (Inria Nancy-Grand Est, Institut Élie Cartan de Lorraine) : Analyse et simulations de modèles individus-centrés et intégro-différentiels de chemostat.



Lundi 09/03/2015


14h -  Sylvie SCHNEIDER-MAUNOURY (IBPS-LBD, UPMC) : Neurogenesis in the cerebral cortex: role of primary cilia.

15h -  Cristobal QUININAO (LJLL, UPMC, CIRB, Collège de France) : Local homeoprotein diffusion can stabilize boundaries generated by graded positional cues.




Lundi 12/01/2015


14h  -   Jean-François JOANNY (Institut Curie) : Cortical actin flow and dynamics of cytokinesis.

15h  -   Raphael VOITURIEZ (Laboratoire Jean Perrin, UPMC) : Active gels, cell motility and cell trajectories.






Année 2014:


Lundi 02/12/2014


14h  -   Min TANG (SJTU, Institute for Natural Sciences) : A Pathway-based Mean-Field Model For E. Coli Chemotaxis: Mathematical Derivation and ints Hyperbolic and Parabolic Limits.




Jeudi 27/11/2014


14h30  -   Thomas STIEHL  (Univ. Heidelberg) : The impact of stem cell dynamics on the clinical course of acute leukemias.




Lundi 17/11/2014


14h  -   Stéphane DOUADY (MSC, Univ. Paris Diderot) : How Life uses Instabilities by Controlling them via Boundary Conditions.

15h  -   Christophe GOLE (Smith College) : Dynamical and Geometric Models in Phyllotaxis.




Lundi 20/10/2014


14h  -   Jean-Michel CAMADRO  (Institut Jacques Monod, Université Paris Diderot) :  The evolution of liver cirrhosis to hepatocellular carcinoma is associated with an expected modification of ubiquitin, and possible perturbation of the ubiquitin-dependent cellular machineries.




Lundi 13/10/2014


14h  -   Rebecca CHISHOLM (Mamba, LJLL) : Emergence of drug tolerance in cancer cell populations: an evolutionary outcome of selection, non-genetic instability and stress-induced adaptation.




Lundi 23/06/2014


14h  -   Gilles WAINRIB (LAGA-Universite Paris 13) : Random neural networks: stability, complexity and memory.

15h  -   Mathieu GALTIER (Inria Sophia Antipolis, Unic CNRS-Gif et EITN) : Reservoir Computing: random representation, learning and noise.





Lundi 16 et Mardi 17/06/2014      

Modeling Tissue Dynamics and Repair








Lundi 07/04/2014


14h  -   Gregory NUEL (LPMA-CNRS) : Belief Propagation in Bayesian Networks and Biomedical Applications.

15h  -   Benjamin AYMARD (LJLL) : Processus de sélection des follicules ovariens: du modèle à la simulation numérique.




Jeudi 3 et Vendredi 04/04/2014      

Mathematics and Biology: 2nd Young Investigators International Workshop






Lundi 24/03/2014


14h  -   Nelly HENRY (Laboratoire Jean Perrin, UPMC) : Propriétés physiques des biofilms bactériens.

15h  -  Mathilde BADOUAL (IMNC, Orsay) : Modélisation de la croissance et de l'invasivité des gliomes.





Lundi 03/03/2014


14h  -   Maria Rita D'ORSOGNA (California State University at Northridge) : Stochastic nucleation in biology.

15h  -  Nicolas MEUNIER (MAP5, Univ. Paris Descartes) : Modélisation de la polarisation et de la motilité cellulaire.



Lundi 03/02/2014


14h10  -   Tommaso LORENZI (LJLL, UPMC) : Effects of space structure and combination therapies on phenotypic heterogeneity and drug resistance in solid tumors.

15h00  - Jean François BERNAUDIN (Hôpital Tenon, UPMC) : Organes normaux et pathologiques, un Lego tissulaire à prendre en compte dans les modélisations.



Jeudi 09/01/2014


15h  -  Wei-Feng XUE (University of Kent - Canterbury) : Prediction of amyloid behavior through analysis of amyloid formation kinetics and fibril length quantification by Atomic Force Microscopy.

15h50  - Suzanne SINDI (University of California - Merced) : Mathematical Modeling of Prion Protein Dynamics and Transmission in Yeast.




Année 2013:

Lundi 16/12/2013


14h  -  Martine BEN AMAR (LPS, ENS) : Morphology and specificity of melanomas.

14h50  - Etienne COUTURIER (Univ. Santiago de Chile) : Etudes géométriques et mécaniques  de deux coques minces :
Déformations isométriques du grain de pollen de Dianella Caerula et croissance de la cellule de S. pombe.



Lundi 18/11/2013


14h  -  Jonathan TOUBOUL (CIRB et INRIA) : Dynamics of Heterogeneous Networks: Insights from Random Matrix Theory.

14h50  - Raphaël ROUX (LPMA-UPMC) : Évolution d'une particule diffusive ralentie en un point.



Lundi 14/10/2013


14h  -  François DELARUE (Univ. de Nice) : Réseau neuronal "integrate-and-fire" de type McKean-Vlasov.



Lundi 30/09/2013


14h  -  Marion LAHUTTE-AUBOIN (Service de radiologie, Hôpital d'instruction des armées du val-de-grâce) : Déflexion et accrochage des fréquences dans le métabolisme cérébral.

14h50  - Olivier MONGA (UMI UMMISCO 209, IRD) : Information Technology and environment sciences: application to microbial decomposition simulation in soil.



Mardi 25/06/2013


15h15  -  L. BERLYAND (Pennsylvania State University) : PDE/ODE models of collective swimming: viscosity, interactions and collisions.




Lundi 10/06/2013


14h  -  Nir GOV (Weizmann Institute) : Shape as a cue: coupling membrane shape, curved protein complexes and the forces of the cytoskeleton.





Lundi 22/04/2013


14h  -  H. T. BANKS (North Carolina State Univ.) : Mathematical and Statistical Modeling of Human Lymphocyte Proliferation Using CFSE Data.






Lundi 15/04/2013


14h  -  Ibrahim CHEDADDI (LJLL) : Modèles mécaniques pour la biologie : agrégats de cellules et réparation tissulaire.

14h45  - Emmanuel FAURE (BioEmergences, Ecole Polytechnique, CNRS) : Reconstruction des dynamiques multi-échelles de la morphogenèse animale.





Lundi 25/03/2013


15h15  -  Alexandre ESCARGUEIL (Laboratoire "Biologie et Thérapeutiques du Cancer", UPMC) : Adaptive Evolution and Resistance to Anti-Cancer Therapies. Part 1 - Biological problem.

16h   - Alexander LORZ (LJLL) : Adaptive Evolution and Resistance to Anti-Cancer Therapies. Part 2 - Mathematical models.




Lundi 18/03/2013


14h  -  Jean-Baptiste LAGAERT (LJK et LEGI, INP et Univ. Grenoble) : Modélisation de la croissance des Gliomes (tumeurs cérébrales)




Lundi 11/02/2013


14h  -  Yann BOURET (Université de Nice) : Physico-chimie et mathématiques pour la prédiction du pH intracellulaire.

14h45  - Romain YVINEC (Univ. Claude Bernard, Lyon 1) : Modèle probabiliste multi-échelle de différentiation cellulaire.




Lundi 04/02/2013


15h15  -  Peter KIM (Université de Sidney) : Modelling protective anti-tumour immunity using a hybrid agent-based and delay differential equation approach.



Mardi 08/01/2013


11h  -  Jean-Philippe LESSARD (Université Laval) : Méthodes de preuve assistée par ordinateur pour l'étude de systèmes d'EDP de type réaction-diffusion.





Année 2012:



Lundi 17/12/2012

10h30 -17h
  -  WORKSHOP ON CELL MOTION BY CHEMOTAXIS.



Lundi 19/11/2012

10h
  -  Irene VIGNON-CLEMENTEL  (REO, INRIA Paris-Rocquencourt et LJLL) : Ecoulements sanguins: aspects multi-échelles et multi-physiques.

11h  -  Magali TOURNUS  (LJLL) : Analyse qualitative d'un modèle du rein : Caractère bien posé et étude asymptotique.




Mardi 23/10/2012

10h30
  -  Anna MARCINIAK-CZOCHRA  (Université de Heidelberg) : Mathematical models of discrete and continuous cell differentiation.





Lundi 15/10/2012

14h
      -  Grégoire NADIN (LJLL, UPMC) : Un modèle d'équation cinétique avec terme de réaction.

14h45  - Benoit LADOUX (Univ. Paris Diderot) : Collective movements of epithelial cells during resealing and migration.




Jeudi 28/06/2012

14h
      -  Veronica Grieneisen (John Innes Centre) : Making heads and tails of cell polarity.

Ce séminaire fait partie du Workshop Potts/Compucell 3D des  28 et 29 juin. Vous êtes tous invités à participer à cette rencontre.




Jeudi 10/05/2012

14h
      -  Emmanuel FARGE (INSERM et Institut Curie) : Mechanogenetic reciprocal coupling in embryonic development and evolution.




Jeudi 12/04/2012

14h
      -  Marc LEFRANC (Univ. Lille 1) : Robustesse et flexibilité de l'horloge circadienne de l'algue microscopique Ostreococcus tauri.




Jeudi 29/03/2012

14h
      -  François GRANER (Institut Curie et Univ. Paris Diderot) : Des mousses dans les mouches, des tenseurs dans les tissus.




Jeudi 22/03/2012

14h
     -  Bruno SIALVE (Naskeo Environement) : Symbiose : couplage production de microalgues et digestion anaérobie pour le traitement d’effluents et la production d’énergie.

14h45 Jacques SAINTE-MARIE (CETMEF, INRIA Paris-Rocquencourt et LJLL) et Anne-Céline BOULANGER (LJLL) : Modèles et méthodes numériques pour le couplage hydrodynamique-biologie. Application à la culture de micro-algues.




Jeudi 08/03/2012

14h
      -  Robin FAHRAEUS (INSERM) : The role of protein-mRNA interactions to control expression and activity in the p53 pathway.




Jeudi 01/03/2012

14h
      -  Nicolas BACAER (IRD) : Dynamique des populations et environnement périodique, du niveau cellulaire aux épidémies.




Jeudi 16/02/2012

14h
      -  Axel BUGUIN (Institut Curie et UPMC) : Comportements collectifs de bactéries.




Jeudi 9/02/2012

14h
      -  Magali RIBOT (Univ. Nice) : Modélisation et simulations numériques de la formation de biofilms phototrophiques.




Jeudi 19/01/2012

14h
      -  Pascal SILBERZAN (Institut Curie) : Collective migration of epithelial cells.

14h45  - Annabelle BALLESTA(INRIA Paris-Rocquencourt et Hopital St-Antoine) : Approche combinée mathématique et expérimentale pour la personnalisation de l'administration chronomodulée du médicament anticancéreux irinotecan.




Jeudi 12/01/2012

14h
      -  Frédérique BILLY (INRIA Paris-Rocquencourt et UPMC-LJLL) : Modélisation du contrôle de la prolifération cellulaire. Application en oncologie.

14h45  - Vincent FROMION (INRA Jouy en Josas) : Des contraintes systémiques à la prédiction mathématique des structures de régulation des cellules bactériennes :  une nouvelle approche s'appuyant sur de l'optimisation convexe.